เนื่องจากเครื่องบินเป็นภัยคุกคามที่สำคัญของเรือดำน้ำ โดยแต่เดิมเรือดำน้ำเกือบไม่มีวิธีตอบโต้เลย ปัจจุบันจึงได้มีการคิดค้นอาวุธต่อสู้อากาศยานที่สามารถยิงจากเรือดำน้ำได้ในขณะดำน้ำแล้วโผล่ขึ้นโคจรในอากาศเข้าหาเป้าเครื่องบินปราบเรือดำน้ำ หรือเฮลิคอปเตอร์ปราบเรือดำน้ำ โดยยิงจากท่อยิงเฉพาะ จรวดต่อสู่อากาศยานของเรือดำน้ำส่วนใหญ่ดัดแปลงมาจากจรวดต่อสู้อากาศยานแบบพื้นสู่อากาศ หรืออากาศสู่อากาศ เช่นจรวด SIDE WINDER เป็นต้น